「New Projectウィザード」で「Java Enterprise」を選んで、いろんなテクノロジを選択するんだけど「Application Server」にGlassfish4を選んでいると「Use library from 'GlassFish 4.0.0' installation」って項目が追加されて、大抵のライブラリをGlassfishから参照するようになる。
これはこれで便利なんだけど、なんでか一部のテクノロジ（たとえばJPA）はGlassfish内にある javax.persistence.jarを参照せずにわざわざダウンロードしてくる。それに小刻みに参照ライブラリを区切るので、あぶれるものが出てきたり（javax.interceptorパッケージが見当たらない、とか）と、手放しで喜ぶほどデキがよくない。(´・ω・`)
なにより、ローカルにあるGlassfish上のライブラリを参照するので、プロジェクトを共有するのに向かない。
だったら、New Projectでヘンに凝ったことせず、せいぜい「Web Application」か「JSF」それも「Set up library later」にして、プロジェクト作っておいて、
あとから「Project Structure」でMavenライブラリ（From Maven...）から「javax:javaee-api:7.0」をダウンロードしたほうが数倍マシ。Scopeは「Provided」でね（Web Profileだと「javax:javaee-web-api:7.0」と指定する）。
。
デプロイ先がGlassfish4だと、ほとんど揃っているので「javaee-api-7.0.jar」はProvidedで済むんだけど、他のAPサーバだと必要に応じてJSFの実装とかWARファイルにバンドルしないとダメなんじゃないかな？
というか、このjavaee-api-7.0.jar（または javaee-web-api-7.0.jar）、NetBeansには入っているのにGlassfishやJavaEE 7 SDKに入ってないってのは、どうゆう了見だ！と思わなくもない。
＃単に自分の探し方が下手なだけ？
ps.
このヘンはNetBeansのほうがマイルドなんだろか...。